La Sala Superior del Tribunal Electoral del Poder Judicial de la Federación (TEPJF) inaplicó, por mayoría de votos, al caso concreto, el artículo décimo séptimo transitorio del Decreto por el que se reforman, adicionan y derogan diversas disposiciones de la Ley General de Instituciones y Procedimientos Electorales, de la Ley General de Partidos Políticos, de la Ley Orgánica del Poder Judicial de la Federación y se expide la Ley General de los Medios de Impugnación en Materia Electoral. Ese artículo ordenó el cese inmediato del titular de la Secretaría Ejecutiva del Instituto Nacional Electoral (INE).
El INE impugnó ante la Sala Superior la aplicación del artículo transitorio al considerar que afectaba el principio de igualdad ante la ley y la autonomía de las funciones del instituto, al constituir una norma privativa con incidencia en sus facultades constitucionales, al ser este el único facultado para el nombramiento y la remoción del cargo en cuestión. Al respecto, se precisa que el titular de la Secretaría Ejecutiva se inconformó respecto de la aplicación de la misma norma, pero se desistió de su acción de forma posterior.
La Sala Superior determinó procedente el desistimiento del actor del juicio de la ciudadanía y, respecto del medio de impugnación del INE, inaplicó el artículo impugnado y ordenó la continuación del cargo de la persona titular de la secretaría ejecutiva.
Por otra parte, la Sala Superior determinó que el artículo impugnado trasgredió una facultad reservada al Consejo General y vulneró la autonomía e independencia funcional, cuyas atribuciones de nombramiento y remoción del cargo referido, están reconocidas constitucionalmente para el INE.