El Club Atlas de Guadalajara hizo oficial la llegada de José Guadalupe Cruz a la dirección técnica del conjunto rojinegro, de cara al Torneo Apertura 2016 de la Liga MX.
Desde hace algunos días, el nombre del “Profe” Cruz se había manejado para sentarse en el banquillo del conjunto rojinegro, lo que finalmente se dio este.
Pese a que no pudo salvar a Dorados de Sinaloa del descenso, Cruz tiene en su palmarés un título con Atlante en el Torneo Apertura 2007, así como la Liga de Campeones de la Concacaf 2009, además de una Copa MX, con Puebla en 2015.
El conjunto de tapatío fracaso en los Torneos Apertura 2015 y Clausura 2016, bajo los mandos del uruguayo Gustavo Matosas y del argentino Gustavo Costas.